Download or read book Segmentation d images multidimensionnelles d IRM cardiaque pour l tude du comportement dynamique et la reconstruction 3d du c ur written by Hamid Abrishami Moghaddam and published by . This book was released on 1998 with total page 183 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Le travail présenté dans ce mémoire est une composante d'un système informatique pour l'analyse de la fonction cardiaque chez l'enfant. L'objectif principal de cette étude est de développer une structure pour l'estimation de la forme volumique, du mouvement et des malformations des cavités cardiaques à partir des données multidimensionnelles d'IRM cardiaque. Nous nous sommes intéressés à définir un protocole d'exploration rapide adapté à l'analyse et à la reconstruction tridimensionnelle du cur. Pour tenir compte de l'ambigüité des informations de l'image, nous proposons un algorithme de segmentation basé sur la théorie de connexité floue. Nous définissons les notions de voisinage, d'affinité, de connexité et d'objet flous. L'algorithme d'extraction d'objets flous permet d'attribuer un degré de connexité à chaque point de l'image en fonction des informations fournies comme les niveaux de gris, la distance ou le mouvement de l'objet. La segmentation s'effectue à partir des degrés de connexité qui sont calculés de façon efficace par la technique de programmation dynamique. Nous proposons ensuite un algorithme basé sur le modèle du contour actif, et une technique de propagation spatio-temporelle des contours afin d'extraire la surface ventriculaire gauche. L'évaluation quantitative et qualitative des résultats de la méthode par comparaison aux traces manuels de contours ne montre pas de différences significatives. L'application de la méthode à une image de variance calculée à partir des données multiphases permet d'estimer la surface externe du cur. Afin de diminuer les erreurs introduites par les méthodes courantes d'interpolation basées sur la scène, une méthode d'interpolation basée sur la forme est généralisée pour les images quatre dimensionnelles en niveaux de gris. Nous démontrons une amélioration significative des résultats obtenus par rapport aux résultats de la méthode linéaire. L'ensemble des algorithmes développés dans le cadre de ce travail, permet de segmenter de façon semi-automatique les images multicoupes-multiphases d'IRM cardiaque. Les résultats obtenus démontrent l'efficacité de ces techniques en terme de détection des informations représentants le cur, et de suppression des points de bruit et des structures environnantes. Les développements effectués sont intégrés au logiciel 3dviewnix, de l'université de Pennsylvanie, sur une station silicon graphics.

Download or read book Segmentation et mod lisation dynamiques written by Antonio Bosnjak Seminario and published by . This book was released on 2003 with total page 228 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Dans le domaine médical, les systèmes d'imagerie sont de plus en plus performants et fournissent un nombre important d'images des structures internes du corps humain. Dans ce contexte, il est essentiel de développer des chaînes de traitement et d'analyse de ces informations afin d'aider le diagnostic médical.En échocardiographie, le traitement et l'analyse quantitatifs décuplent leur potentiel quand on utilise un système d'acquisition 3D. Dans cet objectif, nous avons développé une nouvelle chaîne de traitement qui contribue à améliorer le diagnostic médical à partir de la reconstruction 3D d'images ultrasons. Cette chaîne est divisée en plusieurs modules : acquisition, filtrage, segmentation et reconstruction 3D, modélisation, visualisation, et extraction de paramètres cliniques. Dans chacun des modules on a réalisé plusieurs contributions. La plus importante consiste en un modèle de fusion entre une méthode de segmentation locale évoluée (front de propagation 3D) et un modèle global de superquadriques afin d'extraire de manière précise les parois du ventricule gauche (VG) dans le cas de perte de régions. Cette segmentation permet en outre la visualisation 3D temporelle et le calcul de paramètres cliniques importants.En conclusion, la visualisation 3D du cœur en mouvement, le comportement du modèle virtuel et les valeurs des paramètres cliniques sont des informations importantes pour le cardiologue. Nul doute qu'elles contribueront à diagnostiquer avec une plus grande précision les maladies cardiovasculaires.

Download or read book Segmentation d images de contraction et de rehaussement tardif en IRM cardiaque written by Racha El Berbari and published by . This book was released on 2009 with total page 190 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L’objectif de cette thèse est de contribuer à la réduction de la variabilité inter et intra-observateur due à l’analyse visuelle des images cardiaques en IRM utilisée en routine clinique et du temps passé par l’expert, via le développement d’une méthode de segmentation automatique du ventricule gauche pour apporter une aide au diagnostic. Nos applications concernent à la fois les études dynamiques de la fonction contractile (Ciné) et les images statiques de rehaussement tardif. La méthode de segmentation automatique du ventricule gauche a été développée en utilisant une approche fondée sur les contours actifs. L’apport innovant proposé dans ce travail porte sur une étape de filtrage utilisant les filtres morphologiques, qui a permis de résoudre les problèmes dus à la présence des muscles papillaires dans la cavité et aux inhomogénéités de niveau de gris dans la cavité dues au flux sanguin. Cette méthode, qui a fait l’objet d’une validation en comparant les résultats au tracé réalisé par un expert est robuste et simple à utiliser en clinique. Deux applications cliniques requérant l’utilisation de cette méthode ont été mises en place : l’évaluation de la cinétique pariétale du ventricule gauche sur des images Ciné et la quantification de la transmuralité de l’infarctus du myocarde sur les images de Rehaussement tardif. Dans un dernier temps, pour améliorer la qualité des images de RT3D, une approche de restauration d’images avec préservation des discontinuités a été proposée pour reconstruire un volume de RT hyper-résolu et isotrope à partir de l’acquisition de trois volumes anisotropes suivant les directions classiques : petit axe, grand axe 2-cavités et grand axe 4-cavi

Download or read book Vers une segmentation optimale d images cardiaques acquises par rmn pour la reconstruction tridimensionnelle du coeur written by Malek Makki and published by . This book was released on 1997 with total page 183 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Un protocole d'exploration cardiaque par rmn avec séquence spin-écho a été adapté à la reconstruction tridimensionnelle du coeur avec un double balayage du coeur de l'apex à la base. Les images acquises sont segmentées selon les processus d'extraction optimale des contours afin de retracer le plus fidèlement possible les cavités cardiaques. Cette segmentation automatique comprend un filtrage numérique optimal par approche de canny-deriche, une suppression des maxima non locaux avec interpolation linéaire des pixels adjacents, un seuillage par hysteresis adaptatif avec un seuil haut et un seuil bas en fonction des données statistiques de l'image, et une fermeture des contours avec codage et jonction des extrémités combinant le module et la phase des pixels. La squelettisation est basée sur un opérateur morphologique chapeau-haut-de-forme qui comprend une érosion suivie d'une dilatation avec un élément structurant carré. Les images segmentées sont ensuite regroupées et empilées pour une extrapolation de la troisième dimension qui commence par une interpolation linéaire des pixels en fonction des intensités et des distances inter-coupes. Une homogénéisation des intensités est ainsi produite et les points sont reportés dans un graphe direct dit de voronoi représentant une cartographie des points de contours de chaque plan de coupe. La reconstruire des facettes est appliquée par un processus de triangulation de delaunay qui est basée sur une jonction des vertexes selon le chemin à coût minimal. L'implantation de ces outils est réalisée sur une station type silicon graphics que nous avons configurée par interfaces graphiques pour utilisateur pour l'acquisition, la visualisation et la segmentation automatique des images. Ces applications graphiques conviviales et interactives permettent par leur implantation événementielle selon des fenêtres et des boites de dialogues d'intégrer cette plate-forme dans un site hospitalier. Son extension à l'acquisition et l'analyse des images sous format dicom et l'archivage par un reseau pacs figurent parmi les perspectives.

Download or read book Segmentation interactive d images cardiaques dynamiques written by Kevin Bianchi and published by . This book was released on 2014 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: La thèse porte sur la segmentation spatio-temporelle et interactive d'images cardiaquesdynamiques. Elle s'inscrit dans le projet ANR 3DSTRAIN du programme"Technologies pour la Santé et l'Autonomie" qui a pour objectif d'estimer de façoncomplète, dense et sur plusieurs modalités d'imagerie 3D+t (telles que l'imageriepar résonance magnétique (IRM), la tomographie par émission monophotonique(TEMP) et l'échocardiographie) l'indice de déformation du muscle cardiaque : lestrain. L'estimation du strain nécessite une étape de segmentation qui doit être laplus précise possible pour fournir une bonne évaluation de cet indice. Nos travauxse sont orientés sur deux axes principaux : (1) le développement d'un modèle desegmentation conforme à la morphologie du muscle cardiaque et (2) la possibilitéde corriger interactivement et intuitivement le résultat de la segmentation obtenuegrâce à ce modèle.

Download or read book Segmentation automatique et suivi du mouvement du coeur par mod les d formables lastiques semi lin aire et non lin aire en imagerie par r sonance magn tique written by Youssef Rouchdy and published by . This book was released on 2005 with total page 108 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Le contexte médical de cette thèse est la quantification de la fonction contractile (fonction mécanique) du coeur, dans le but d'améliorer le diagnostic de certaines pathologies cardio-vasculaires telles que l'ischémie myocardique. Il s'agit d'abord d'extraire d'images acquises chez le patient l'anatomie du coeur. Cette opération, dénomée segmentation dans la terminologie du traitement d'images, reste un problème ouvert. L'approche de segmentation étudiée dans ce manuscrit est basée sur le principe des modèles déformables volumique. Elle est baptisée Gabarit Déformable Elastique (GDE). On se donne d'abord une représentation géométrique qui est proche de l'objet à segmenter. Ce modèle est positionné dans l'image par une transformation affine à proximité de la structure à extraire. Le GDE est ensuite déformé avec un champ de forces issu de l'image pour s'ajuster aux surfaces de l'objet étudié. La contribution de cette thèse porte sur cette dernière étape de déformation du modèle. Le problème est formulé en terme d'optimisation sous contrainte de régularité des déformations et sous des contraintes géométriques. L'énergie globale est composée de deux termes ; le premier terme (d'attache aux données) est calculé à partir des données d'image. Son rôle est de guider les déformations du modèle vers la structure cible. Le second introduit une contrainte de régularité sur les déformations souhaitées. Sa présence assure que le problème est bien posé dans un espace fonctionnel approprié. Nous considérons les cas où, le terme de régularisation est celui de l'élasticité linéaire et d'une régularisation non-linéaire. Ceci nous conduit à l'étude de trois GDE : le premier modèle est celui de l'élasticité linéaire sous contraintes géométriques. La minimisation de l'énergie linéaire sous contrainte de champ nul aux frontières de l'objet impose aux déplacements à transporter la frontière du GDE vers les points d'annulation du champ de forces (positionnement des surfaces). Nous donnons un résultat d'existence d'un minimum et des conditions nécessaires d'optimalité ainsi qu'un algorithme permettant d'approcher une solution des conditions d'optimalité. Le deuxième modèle est hyperélastique. Son étude se ramène à un problème d'élasticité non-linéaire en traction pure avec des forces suiveuses (les forces dépendant des déplacements). Nous donnons un résultat d'existence et d'unicité local, ainsi que des conditions suffisantes de convergence d'un algorithme incrémental permettant d'en trouver la solution. Finalement, nous proposons un modèle qui consiste à déplacer le domaine en résolvant successivement une suite de problèmes linéaires. L'approche linéaire ne s'applique que dans des cas de petits déplacements, par contre l'approche non-linéaire est valable pour des grands déplacements. Les algorithmes proposés sont mises en oeuvre avec la méthode des éléments finis. Le modèle non-linéaire hyperélastique est appliqué à la segmentation 3D et au suivi du coeur en imagerie cardiaque, notamment en Imagerie par Résonance Magnétique (IRM). Les résultats obtenus sur des cas réels montrent la pertinence et l'intérêt de notre approche. Le principe de ce modèle est générique et permet d'envisager son application à la segmentation de formes variées

Download or read book Segmentation et suivi de structures par mod le d formable lastique non llin aire written by Joël Schaerer and published by . This book was released on 2008 with total page 110 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: ...Dans le cadre de cette thèse, nous nous sommes focalisés sur l'évolution de la méthode du Gabarit Déformable Élastique (GDE) pour l'extraction automatique de l'anatomie cardiaque (cavités ventriculaires et enveloppe péricardique), développée au laboratoire Creatis-LRMN. Le GDE consiste à représenter le myocarde par un modèle de forme a priori que l'on déforme élastiquement pour l'adapter à la forme spécifique du coeur du patient. Au cours de cette thèse, un nouvel algorithme non-linéaire, permettant une meilleure prise en compte de la variabilité de la forme du coeur, a été développé en collaboration avec l'Institut Camille Jordan de Mathématiques Appliquées à Lyon. La collaboration avec des mathématiciens permet d'asseoir nos travaux sur des bases théoriques solides : une preuve de convergence de l'algorithme a été proposée [1). Nous proposons en outre une méthode de multirésolution sur le maillage qui permet une accélération significative de l'algorithme, ainsi qu'une méthode de perturbation singulière permettant de s'assurer que le modèle est parfaitement adapté aux données [2]. Parallèlement, un travail a été réalisé pour l'amélioration de l'attache aux données [3] et en particulier du champ de force qui guide la déformation du gabarit, de manière à améliorer la robustesse de la méthode, notamment avec les données issues des imageurs modernes. Nous proposons également plusieurs contributions pour le positionnement initial du modèle dans les images. En particulier, l'utilisation d'un recalage par fonctions splines de plaque mince a été proposé [4], en collaboration avec le Professeur L. Axel à New York. Enfin, nous proposons d'étendre le GDE pour une modélisation dynamique et non plus statique du coeur, en s'appuyant sur une représentation harmonique du mouvement sur l'ensemble du cycle cardiaque et en proposant un algorithme original de résolution [5, 6]. Cette dernière proposition constitue sans doute la principale contribution de notre travail. Elle s'appuie là-aussi sur des résultats théoriques. Les méthodes proposées sont évaluées sur des données de synthèse et des données réelles acquises chez l'homme et le petit animal.

Download or read book Segmentation et suivi de structures par mod le d formable lastique non llin aire written by Joël Schaerer and published by . This book was released on 2008 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: ...Dans le cadre de cette thèse, nous nous sommes focalisés sur l'évolution de la méthode du Gabarit Déformable Élastique (GDE) pour l'extraction automatique de l'anatomie cardiaque (cavités ventriculaires et enveloppe péricardique), développée au laboratoire Creatis-LRMN. Le GDE consiste à représenter le myocarde par un modèle de forme a priori que l'on déforme élastiquement pour l'adapter à la forme spécifique du coeur du patient. Au cours de cette thèse, un nouvel algorithme non-linéaire, permettant une meilleure prise en compte de la variabilité de la forme du coeur, a été développé en collaboration avec l'Institut Camille Jordan de Mathématiques Appliquées à Lyon. La collaboration avec des mathématiciens permet d'asseoir nos travaux sur des bases théoriques solides : une preuve de convergence de l'algorithme a été proposée [1). Nous proposons en outre une méthode de multirésolution sur le maillage qui permet une accélération significative de l'algorithme, ainsi qu'une méthode de perturbation singulière permettant de s'assurer que le modèle est parfaitement adapté aux données [2]. Parallèlement, un travail a été réalisé pour l'amélioration de l'attache aux données [3] et en particulier du champ de force qui guide la déformation du gabarit, de manière à améliorer la robustesse de la méthode, notamment avec les données issues des imageurs modernes. Nous proposons également plusieurs contributions pour le positionnement initial du modèle dans les images. En particulier, l'utilisation d'un recalage par fonctions splines de plaque mince a été proposé [4], en collaboration avec le Professeur L. Axel à New York. Enfin, nous proposons d'étendre le GDE pour une modélisation dynamique et non plus statique du coeur, en s'appuyant sur une représentation harmonique du mouvement sur l'ensemble du cycle cardiaque et en proposant un algorithme original de résolution [5, 6]. Cette dernière proposition constitue sans doute la principale contribution de notre travail. Elle s'appuie là-aussi sur des résultats théoriques. Les méthodes proposées sont évaluées sur des données de synthèse et des données réelles acquises chez l'homme et le petit animal

Download or read book D veloppement d une m thode de segmentation applicable aux images d IRM cardiaque written by Christelle Cassen and published by . This book was released on 2001 with total page 220 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Nous présentons dans ce travail une nouvelle méthode de segmentation du ventricule gauche sur des images HM petit axe. Cette segmentation est basée sur un algorithme de découpe/fusion. Les contours endocardique et épicardique sont tracés manuellement sur la première image d'une série temporelle. Les autres contours de la série sont tracés automatiquement en tenant compte des contours précédents. Cet algorithme intègre les caractéristiques topologiques et géométriques du ventricule gauche au cours du temps. Il a été développé sur une plate-forme mettant en oeuvre une structure de données combinant un modèle géométrique et un modèle topologique. Le modèle topologique repose sur le concept des cartes combinatoires. Cette méthode est robuste malgré le bruit, les artefacts et le contraste variant au cours du temps. Elle a été validée par étude des reproductibilités intra et inter observateurs pour 33 séquences temporelles.

Download or read book Segmentation d IRM c r brales multidimensionnelles par coupe de graphe written by Jérémy Lecoeur and published by . This book was released on 2010 with total page 217 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Cette thèse traite de la segmentation d'IRM cérébrales multimodales par des méthodes de coupe de graphe. Tout d'abord, nous proposons une méthode qui utilise conjointement trois modalités IRM. L'information de frontière, donnée par le gradient spectral, est mis en balance avec l'information de région, donnée par des graines sélectionnées par l'utilisateur. Ensuite, nous proposons trois variantes. La première consiste à trouver un espace spectral optimal car le gradient spectral est basé sur les images naturelles donc inadapté aux images médicales multimodales. Nous explorons ensuite l'automatisation de notre méthode. Ici, les informations de région sont déduites par un algorithme EM robuste. Enfin, nous intégrons l'utilisation d'atlas pour la segmentation automatique de structures profondes du cerveau. Nos différentes méthodes de segmentation se montrent meilleures que la plupart de celles actuellement utilisés, aussi bien en terme de temps de calcul qu'en précision de segmentation.

Download or read book Vers une segmentation optimale d images cardiaques acquises par RMN pour la reconstruction tridimentsionnelle du coeur written by Malek Makki and published by . This book was released on 1997 with total page pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt:

Download or read book Segmentation automatis e du ventricule gauche en IRM cardiaque written by Constantin Constantinides and published by . This book was released on 2012 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Cette thèse a pour objectif de parvenir à une estimation automatisée des contours du ventricule gauche sur des images IRM en coupes petit-axe, nécessitant un minimum d'interventions de la part de l'utilisateur. En s'appuyant sur une approche semi-automatique récemment développée, une méthode entièrement automatique est proposée, reposant sur la localisation des structures cardiaques et la création d'une région d'intérêt autour du ventricule gauche, puis la segmentation de sa cavité. L'algorithme a été développé en prenant en compte des connaissances anatomiques et fonctionnelles sur le cœur : les caractéristiques temporelles du battement cardiaque, la pseudo-circularité des coupes petit-axe du ventricule gauche, la continuité 3D qui ont été combinées à l'intensité dans les images. La segmentation utilise une approche fondée sur les contours actifs combinée à un filtrage morphologique qui améliore la robustesse de la segmentation vis-à-vis des hétérogénéités au sein de la cavité. Le travail réalisé avec le groupe MedIEval (MedicalImaging Evaluation) a permis de comparer les deux méthodes avec 6 autres méthodes, dont 3 tracés d'experts. Une classification par une approche d'évaluation sans référence a été appliquée à la fraction d'éjection estimée par les 8 méthodes. Enfin, la méthode de segmentation proposée a été utilisée systématiquement dans une étude de recherche clinique combinant l'étude de la contraction régionale et la quantification de la transmuralité de l'infarctus du myocarde. Ces travaux ouvrent des perspectives, sur l'automatisation de la segmentation du ventricule droit et l'estimation d'une forme mutuelle robuste à partir de plusieurs segmentations.

Download or read book ANALYSE D IMAGES IRM 3D MULTIECHOS POUR LA DETECTION ET LA QUANTIFICATION DE PATHOLOGIES CREBRALES written by Lars Aurdal and published by . This book was released on 1997 with total page 220 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: CETTE THESE PORTE SUR DES METHODES DE MESURE ET D'ANALYSE DES STRUCTURES ANATOMIQUES ET PATHOLOGIQUES DANS DES IMAGES EN IRM DU CORPS HUMAIN. NOUS NOUS SOMMES PRINCIPALEMENT CONCENTRES SUR DES IMAGES IRM DU CERVEAU, EN PARTICULIER NOUS AVONS ETUDIE CELLES DU CERVEAU DE PATIENTS SOUFFRANT D'ADRENOLEUKODYSTROPHIE (ALD), UNE MALADIE NEUROLOGIQUE TRES GRAVE TOUCHANT PRINCIPALEMENT LES JEUNES GARCONS. CE TYPE DE MESURES EST D'UNE TRES GRANDE IMPORTANCE POUR LE SUIVI DES THERAPIES A L'ESSAI. LA METHODE COURAMMENT UTILISEE POUR FAIRE CE GENRE DE MESURES REPOSE SUR UN CONTOURAGE MANUEL, QUI EST DIFFICILE ET SUJET A DES ERREURS IMPORTANTES. LA VARIABILITE INTRA- ET INTER-OBSERVATEURS EST GENERALEMENT GRANDE, EN PARTICULIER A CAUSE DE LA GEOMETRIE COMPLEXE DE LA REGION PATHOLOGIQUE. LE PROBLEME PRINCIPAL A RESOUDRE AVANT D'OBTENIR LES MESURES DESIREES EST LE PROBLEME DE SEGMENTATION DES IMAGES IRM EN REGIONS REPRESENTATIVES DES STRUCTURES ANATOMIQUES. CE PROBLEME DE SEGMENTATION EST COMPLIQUE DU FAIT QUE L'INFORMATION CONCERNANT LA TAILLE ET LA POSITION DES STRUCTURES D'INTERET EST GENERALEMENT REPARTIE ENTRE PLUSIEURS IMAGES. POUR OBTENIR UNE BONNE SEGMENTATION DE CES IMAGES ON A DONC BESOIN D'UN ALGORITHME QUI PERMETTE LA FUSION DES INFORMATIONS EN MEME TEMPS QUE LA SEGMENTATION. NOUS AVONS DEVELOPPE POUR CELA UN ALGORITHME DE SEGMENTATION DE TYPE MARKOVIEN QUI S'EST MONTRE TRES EFFICACE POUR CE GENRE DE PROBLEME. UNE PARTIE IMPORTANTE DES ALGORITHMES QUE NOUS AVONS DEVELOPPES PENDANT CETTE THESE CONCERNE L'ESTIMATION DES CARACTERISTIQUES DES CLASSES DANS LES DIFFERENTES IMAGES. L'INTERET DE TELS ALGORITHMES EST QU'ILS PERMETTENT D'AUTOMATISER PRESQUE ENTIEREMENT LE PROCESSUS DE SEGMENTATION. POUR RESOUDRE CE PROBLEME, NOUS AVONS CHOISI UNE APPROCHE D'ANALYSE MULTI-ECHELLES DES HISTOGRAMMES DES IMAGES A SEGMENTER AFIN D'EN DETERMINER LES MODES. CET ALGORITHME EST REMARQUABLEMENT ROBUSTE ET FOURNIT DE BONS RESULTATS EN PRATIQUE. L'ALGORITHME PROPOSE INITIALEMENT DONNE COMME RESULTAT CE QUE NOUS AVONS APPELE UNE SEGMENTATION DISCRETE, C'EST-A-DIRE DES RESULTATS OU CHAQUE PIXEL EST CONSIDERE COMME APPARTEMENT A UNE SEULE CLASSE. DANS CERTAINS CAS CELA EST UNE LIMITE DE LA METHODE, SURTOUT DANS LE CAS DE COUPES EPAISSES OU BEAUCOUP DE PIXELS CONTIENNENT DES MELANGES DE TISSUS. NOUS AVONS DONC DEVELOPPE UNE EXTENSION DE L'ALGORITHME INITIAL EN UN ALGORITHME DE SEGMENTATION EN ETIQUETTES CONTINUES QUI PERMET LA SEGMENTATION DE TELS PIXELS ET L'ESTIMATION DES POURCENTAGES DES TISSUS QUI LE COMPOSENT. AFIN DE PERMETTRE UNE UTILISATION FACILE DE CES ALGORITHMES DANS UN MILIEU MEDICAL NOUS AVONS AUSSI DEVELOPPE UNE INTERFACE GRAPHIQUE POUR TOUS CES ALGORITHMES. CETTE INTERFACE EST CONCUE EN MOTIF ET PERMET UNE MANIPULATION SIMPLE DES PARAMETRES NECESSAIRES POUR LA SEGMENTATION, LES IMAGES A SEGMENTER ET LES RESULTATS DE SEGMENTATION. L'INTERFACE PERMET AUSSI DE FAIRE DES MESURES DE LA TAILLE DE CERTAINES REGIONS DANS LES IMAGES SEGMENTEES. LES RESULTATS DE SEGMENTATION PEUVENT AUSSI ETRE MANIPULES AFIN DE CORRIGER DES ERREURS POSSIBLES DANS LES RESULTATS. LES EXPERIENCES MENEES EN MILIEU CLINIQUE SONT TRES POSITIVES.

Download or read book Environnement de simulation pour l valuation des algorithmes de reconstruction 3D en angiographie rotationnelle R X written by Guanyu Yang and published by . This book was released on 2008 with total page 133 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: Nous proposons un environnement de simulation pour évaluer les algorithmes de reconstruction 3D en imagerie rotationnelle R-X. Il comprend la construction d'un modèle dynamique coeur vaisseau à partir d'une séquence volumique acquise en imagerie scanner multibarette (une séquence étant constituée de 10 volumes extraits tous les 10% du cycle cardiaque), la modélisation du système d'acquisition rotationnel angiographique R-X et le calcul des images de projection à partir du modèle dynamique 3D Coeur vaisseau sur plusieurs cycles cardiaques.

Download or read book Segmentation d images IRM anatomiques par inf rence bay sienne multimodale et d tection de l sions written by Stéphanie Bricq and published by . This book was released on 2008 with total page 144 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L'imagerie médicale fournit un nombre croissant de données. La segmentation automatique est devenue une étape fondamentale pour l'analyse quantitative de ces images dans de nombreuses pathologies cérébrales comme la sclérose en plaques (SEP). Nous avons focalisé notre étude sur la segmentation d'IRM cérébrales. Nous avons d'abord proposé une méthode de segmentation des tissus cérébraux basée sur le modèle des chaînes de Markov cachées, permettant d'inclure l'information a priori apportée par un atlas probabiliste et prenant en compte les principaux artefacts présents sur les images IRM. Nous avons ensuite étendu cette méthode à la détection de lésions SEP grâce à un estimateur robuste. Nous avons également développé une méthode de segmentation d'IRM 3D basée sur les contours actifs statistiques pour raffiner la segmentation des lésions. Les résultats obtenus ont été comparés avec d'autres méthodes de segmentation et avec des segmentations manuelles réalisées par des médecins.

Download or read book Mise en oeuvre d un syst me de reconstruction adaptif pour l IRM 3D des organes en mouvement written by Anne Menini and published by . This book was released on 2013 with total page 0 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: L'Imagerie par Résonance Magnétique (IRM) présente deux caractéristiques principales. La première, sa capacité à manipuler le contraste, constitue son principal avantage par rapport aux autres modalités d'imagerie. Cela permet d'obtenir des informations complémentaires pour une meilleure détectabilité et une meilleure précision dans le diagnostic. Cela est particulièrement appréciable pour les pathologies du myocarde. La seconde caractéristique de l'IRM est également l'un de ces principaux inconvénients : le processus d'acquisition est relativement lent. De ce fait, les mouvements du patient constituent un obstacle important puisqu'ils perturbent ce processus d'acquisition, ce qui se traduit par des artéfacts dans l'image reconstruite. L'imagerie cardiaque et abdominale sont donc particulièrement sensibles à cette problématique du mouvement. L'objectif de cette thèse est donc de proposer une méthode de correction de mouvement intégrable dans un contexte multi-contraste. Nous avons étudié dans un premier temps la question de la correction de mouvement seule. Pour cela, nous nous sommes plus particulièrement intéressés à la méthode GRICS déjà développée au laboratoire IADI. Cette méthode permet la reconstruction conjointe d'une image sans artéfact et d'un modèle de mouvement non rigide permettant de corriger les déplacements qui surviennent pendant l'acquisition. Le premier apport majeur de cette thèse a consisté à améliorer la méthode GRICS, notamment pour l'adapter à l'imagerie volumique 3D. Il s'agit d'une nouvelle méthode de régularisation adaptative particulièrement adaptée au problème inverse posé dans GRICS. Le second apport majeur de cette thèse a consisté à gérer la correction de mouvement GRICS de manière conjointe sur des acquisitions présentant des contrastes différents. Il s'agit de concevoir l'examen IRM comme un tout et d'exploiter au mieux les informations partagées entre les différents contrastes. Toutes ces méthodes ont été appliquées et validées par des simulations, des tests sur fantôme, sur volontaires sains et sur des patients dans la cadre d'études cliniques. L'application cardiaque a été particulièrement visée. Les méthodes développées ont permis d'améliorer le processus d'acquisition et de reconstruction dans le contexte clinique réel.

Download or read book ETUDE DE LA DYNAMIQUE CARDIAQUE PAR ANALYSE D IMAGES TRIDIMENSIONNELLES written by JEROME.. DECLERCK and published by . This book was released on 1991 with total page 261 pages. Available in PDF, EPUB and Kindle. Book excerpt: LES MALADIES CARDIOVASCULAIRES DEMEURENT A CE JOUR LA PREMIERE CAUSE DE MORTALITE DANS LES PAYS OCCIDENTAUX DEVELOPPES. LE DIAGNOSTIC D'UNE PATHOLOGIE PERMET DE PRESCRIRE AU PATIENT UNE THERAPIE ADAPTEE AVEC UN SUCCES D'AUTANT PLUS GRAND QUE LA DETECTION EST PRECOCE. NOUS NOUS INTERESSONS DANS CETTE THESE A L'ETUDE DE LA DYNAMIQUE CARDIAQUE PAR ANALYSE D'IMAGES TRIDIMENSIONNELLES, PLUS PRECISEMENT A L'ETUDE DU VENTRICULE GAUCHE, LA POMPE PRINCIPALE DU SYSTEME DE CIRCULATION SANGUINE. LA PREMIERE PARTIE DE CES TRAVAUX PORTE SUR L'ETUDE DE LA PERFUSION MYOCARDIQUE PAR TOMOSCINTIGRAPHIE (SPECT) : DANS CETTE ETUDE, DEUX IMAGES 3D FONCTIONNELLES DU VENTRICULE GAUCHE SONT ACQUISES AFIN DE DETECTER, PAR COMPARAISON, D'EVENTUELLES ISCHEMIES OU INFARCTUS. UN OUTIL A ETE DEVELOPPE POUR METTRE EN CORRESPONDANCE CES IMAGES DE FACON AUTOMATIQUE ET DE NORMALISER LA GEOMETRIE DE CES IMAGES DANS UN COEUR DE REFERENCE, EN VUE D'UNE QUANTIFICATION OBJECTIVE EN 3D DE L'ETENDUE D'UNE PATHOLOGIE. CET OUTIL A ETE MIS AU POINT SUR UNE BASE DE DONNEES D'ENTRAINEMENT DE 40 CAS ET EVALUE SUR UNE BASE DE DONNEES DE ROUTINE DE 250 CAS AVEC UN SUCCES DE 97 %. LA SECONDE PARTIE DE CES TRAVAUX PORTE SUR L'ETUDE DU MOUVEMENT DU VENTRICULE GAUCHE : NOUS DECRIVONS UNE CLASSE DE TRANSFORMATIONS PLANISPHERIQUES 4D QUI PERMETTENT DE DECRIRE LE MOUVEMENT DU VENTRICULE EN 4D (ESPACE + TEMPS). CES TRANSFORMATIONS SONT CONTINUES, DEFINIES GRACE A LA DONNEE D'UN NOMBRE REDUIT DE PARAMETRES. ELLES SONT DECRITES DANS UNE GEOMETRIE PARTICULIEREMENT ADAPTEE, PERMETTANT UNE ECRITURE SIMPLE DE LA TRANSFORMATION. DE PLUS, IL EST POSSIBLE DE REALISER UNE DECOMPOSITION DU MOUVEMENT DONT LA DESCRIPTION SPATIALE ET TEMPORELLE FOURNIT DE PARAMETRES QUANTITATIFS EN VUE D'UNE ANALYSE OBJECTIVE ET, POTENTIELLEMENT, ET D'UN DIAGNOSTIC INDEPENDANT DE L'OPERATEUR. LA METHODE A ETE TESTEE SUR DES SEQUENCES D'IMAGES TOMOSCINTIGRAPHIQUES SYNCHRONISEES A L'ELECTRO-CARDIOGRAMME (GATED SPECT) ET PAR IRM MARQUEES (TAGGED MRI).